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마이크로바이옴 분석
과정소개
QIIME 2 를 이용한 microbiome 분석 방법을 학습하고 실습
학습목표
1. Microbiome 분석에 이용되는 metagenomics에 관하여 학습
2. QIIME 2 pipeline에 관하여 학습
3. QIIME 2 설치 및 데이터 처리에 관한 실습
4. Demultiplexing sequencing data 실습
5. Denoise 및 Clustering 작업 수행
6. 다양성 분석을 위한 phylogenetic tree 생성 작업 실습
7. 다양성 (Diversity) 분석 실습
8. Alpha diversity 분석 방법 학습/실습 및 결과 해석
9. Beta diversity 분석 방법 학습/실습 및 결과 해석
10. Taxonomic analysis 실습
11. Differential abundance test 수행 및 결과 분석
2. QIIME 2 pipeline에 관하여 학습
3. QIIME 2 설치 및 데이터 처리에 관한 실습
4. Demultiplexing sequencing data 실습
5. Denoise 및 Clustering 작업 수행
6. 다양성 분석을 위한 phylogenetic tree 생성 작업 실습
7. 다양성 (Diversity) 분석 실습
8. Alpha diversity 분석 방법 학습/실습 및 결과 해석
9. Beta diversity 분석 방법 학습/실습 및 결과 해석
10. Taxonomic analysis 실습
11. Differential abundance test 수행 및 결과 분석
강의목차
| 차시 | 강의명 |
|---|---|
| 1차시 | Microbiome analysis; Hands on tutorial – QIIME 2 module I(경희대 이재형) |
| 2차시 | Microbiome analysis; Hands on tutorial – QIIME 2 module II(경희대 이재형) |
| 3차시 | Microbiome analysis; Hands on tutorial – QIIME 2 module III(경희대 이재형) |
| 4차시 | Microbiome analysis; Hands on tutorial – QIIME 2 module IV(경희대 이재형) |
| 5차시 | Microbiome analysis; Hands on tutorial – QIIME 2 module V(경희대 이재형) |