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아주 쉬운 유전체 분석 - 실습편 (2019)
과정소개
강의목차
| 차시 | 강의명 |
|---|---|
| 1차시 | R programming (아주대 최지혜)- 1. R introduction |
| 2차시 | R programming (아주대 최지혜)- 2. Data type |
| 3차시 | R programming (아주대 최지혜)- 3. Function and practice |
| 4차시 | R programming (아주대 최지혜)- 1. Conditional and Control Flow |
| 5차시 | R programming (아주대 최지혜)- 2. iterations : Loop |
| 6차시 | R programming (아주대 최지혜)- 3. Function : The apply family |
| 7차시 | Bioconductor (아주대 지별아)- 1. Introduction to Bioconductor |
| 8차시 | Bioconductor (아주대 지별아)- 2. ExpressionSet |
| 9차시 | Bioconductor (아주대 지별아)- 3. Granges |
| 10차시 | Bioconductor (아주대 지별아)- 4. Preprocessing |
| 11차시 | Differentially expressed genes using DESeq (아주대 지별아)- 1. Data analysis 이론 설명 |
| 12차시 | Differentially expressed genes using DESeq (아주대 지별아)- 2. DESeq 실습 - 1 |
| 13차시 | Differentially expressed genes using DESeq (아주대 지별아)- 2. DESeq 실습 - 2 |
| 14차시 | Clustering and Classification (아주대 지별아)- 1. Classifiation and Clusturing 이론 설명 |
| 15차시 | Clustering and Classification (아주대 지별아)- 2. hclust in R -1 |
| 16차시 | Clustering and Classification (아주대 지별아)- 2. hclust in R -2 |
| 17차시 | GO/Pathway analysis (아주대 최지혜)- 2. g:Progiler |
| 18차시 | 공개데이터 분석 (GEO) (아주대 최지혜)- 1. GEO : Gene Expression Omnibus |
| 19차시 | 공개데이터 분석 (GEO) (아주대 최지혜)- 2. GEO2R |
| 20차시 | 공개데이터 분석 (GEO) (아주대 최지혜)- 3. GSEA/MSigDB |