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수강신청
아주 쉬운 유전체 분석 (2021)
과정소개
본 과정은 사전 선발된 인원만 수강신청 하실 수 있습니다.
K-Genome Lectures 2021
K-GENOME 유전체빅데이터 인력양성 사업단에서 2021년도 [의생명과학도를 위한 아주 쉬운 유전체 분석] 강의를 개최합니다.
의생명과학도 대학원생 및 일반인을 대상으로 하는 프로그램으로 유전체 분석의 이론, 실습 교육 등을 통해 실전 활용 능력을 키우고자 프로그램을 구성하였습니다.
코로나 사태로 인해 모든 교육강의는 온라인으로 진행됩니다. 본 과정은 참여대학들이 공동으로 교육프로그램을 개발하여 교육생들에게 제공하며, 참여대학의 대학원 정규교과목으로도 활용됩니다.
동시에 공개 교육생 모집을 통해 일반인에게도 교육의 기회를 제공하고자 합니다.
교육생의 평가를 강화하여 과제 수행을 통해 평가를 시행하고, 최종 시험에 합격한 교육생에게 유전체데이터분석사 자격증을 발급해 드립니다.
1. 개요
● 목 적 : 의/생명 전공자들을 대상으로 하는 초급 입문과정.
● 과 정 명 : 의생명과학도를위한 아주 쉬운 유전체 분석
● 교 육 비 : 무료
● 주관 : K-Genome 유전체빅데이터 전문인력양성 사업단
● 참여 기관 : 한국바이오협회
● 후원 : 과학기술정보통신부
2. 교육대상, 기간 및 장소
● 대상 : 의생명정보 관련 전공 대학원생 및 일반인 (대학원생, 학부생 우선선발)
● 기간 : 2021.09.01 ~ 2020.12.08 (총 15주,매주 수요일, 오후 5시~8시)
● 장소 : 온라인교육으로 진행
3. 교육 프로그램
● 유전체 분석 입문 및 분석이론
- Next Generation Sequencing
- Single cell sequencing
- Cancer genomics
● 유전체 분석 실습
- R/Bioconductor
- Differential Expression Analysis
- R을 이용한 데이터 시각화
- 유전체전장 Analysis
- RNA-Seq Analysis
- 공개데이터 활용분석 (GEO/TCGA)
- Gene Set Analysis/ Network Analysis
- Single Cell Analysis
● 평가
- 실습 과제 수행평가를 실시
- 최종 시험에 합격한 교육생들에게 유전체데이터분석사 자격증 발급
* 프로그램 및 강사진은 교육일정표 참조 (https://url.kr/47wfud) (변동가능)
* 기타 홈페이지 참조 http://k-genome.org
* 문의 : lecture@k-genome.org
수료기준
| 평가기준 | 진도 | 시험 | 과제 | 토론 | 기타 |
|---|---|---|---|---|---|
| 배점 | 0% | 100% | 0% | 0% | 0% |
| 과락기준 | 100% | 0점 | 0점 | 0점 | 0점 |
강의목차
| 차시 | 강의명 |
|---|---|
| 데이터 기초 | |
| 1차시 | LAB01_리눅스기초(아주대 조성호) |
| 2차시 | R programming I(아주대_최지혜) |
| 3차시 | R programming II(아주대_권소미) |
| 4차시 | R programming III(아주대_최지혜) |
| RNA-SEQ | |
| 5차시 | RNA-SEQ Technology_이론(아주대_박대찬) |
| 6차시 | RNA-SEQ processing(아주대_박대찬) |
| 7차시 | Bioconductor(아주대_최지혜) |
| 8차시 | Clustering/Classification(아주대_최지혜) |
| 공개유전체데이터 | |
| 9차시 | 공개유전체 데이터 실습 (GEO/SRA) (아주대_김규태) |
| 10차시 | 공개유전체 데이터 활용(CMAP/LINCS)(아주대_권소미) |
| 11차시 | 공개유전체 데이터 활용 (TCGA)(아주대_최지혜) |
| 12차시 | Network analysis(아주대_권소미) |
| 유전체실습 | |
| 13차시 | LAB02_RNASeq_preprocessing(아주대 이병길) |
| 14차시 | LAB03_RNASeq_expressionSet(아주대 최지혜) |
| 15차시 | LAB04_RNASeq_DEG_GO(아주대 최지혜) |
| 유전체데이터-WGS | |
| 16차시 | WES_01_1(서울대 최무림) |
| 17차시 | WES_01_2(서울대 최무림) |
| 18차시 | WES_02_1(서울대 최무림) |
| 19차시 | WES_02_2(서울대 최무림) |
| 20차시 | WES_03(서울대 최무림) |
| 21차시 | WES_03_실습(서울대 최무림) |
| 22차시 | WES_04(서울대 최무림) |
| 23차시 | WES_04_실습1(서울대 최무림) |
| 24차시 | WES_04_실습2(서울대 최무림) |
| 25차시 | WES_04_실습3(서울대 최무림) |
| 26차시 | WES_05(서울대 최무림) |
| 27차시 | WES_06(서울대 최무림) |
| 28차시 | WGS_1_convert(서울대 최무림) |
| 29차시 | WGS_실습1(서울대 최무림) |
| 30차시 | WGS_실습2(서울대 최무림) |
| Epigenomics | |
| 31차시 | Epigenomics-1강(포항공대 노태영, 2021) |
| 32차시 | Epigenomics-2강(포항공대 노태영, 2021) |
| 33차시 | Epigenomics-3강(포항공대 노태영, 2021) |
| Single cell Genomics | |
| 34차시 | Single Cell Sequencing 분석 I (아주대_김규태) |
| 35차시 | Single Cell Sequencing 분석 II (아주대_김규태) |
| 36차시 | Data Analysis for Single-Cell RNA-Seq I (아주대 임수빈) |
| 37차시 | Data Analysis for Single-Cell RNA-Seq II (아주대 임수빈) |
| 38차시 | Data Analysis for Single-Cell RNA-Seq III (아주대 임수빈) |
| 39차시 | Data Analysis for Single-Cell RNA-Seq IV (아주대 임수빈) |
| 40차시 | miRNA_session1(한양대 남진우) |
| 41차시 | miRNA_session2(한양대 남진우) |
| 42차시 | 액체생검 (연세대 방두희) |